Inkubátor je nedílnou součástí vybavení chovatele, který se bude snažit odchovat mláďata. Vajíčka by totiž v teráriu dlouho nevydržela jelikož tam nemůžeme vytvořit podmínky vhodné k vývinu zárodků. Inkubátor si buď můžete sami vyrobit nebo zakoupit. Koupě inkubátoru však pro mnohé z nás není levnou záležitostí (pár tisíc byste do něj museli vrazit, aby za něco stál).

Po nakladení a odebrání vajíček z terária je uložíme do misky buď s vermikulitem nebo rašeliníkem, kterou vložíme do inkubátoru. Pokud používáme inkubátor s vodním ohřevem, nemělo by dojít ke kapání vody přímo na vajíčka. S vajíčky během inkubace nesmíme manipulovat,jelikož by mohlo dojít k úhynu embrya. To znamená, že po prohlédnutí (prosvícení aj.) je umístíme do přesně stejné polohy, v jaké byla předtím, jinak by mohlo dojít k úhynu embrya.Prvních 24 hodin to však není nebezpečné.

Doba inkubace u agam kočinčinských trvá přibližně 65-90 dní, záleží na teplotě. Pokud bude teplota vyšší, vývin embryí bude rychlejší a k líhnutí dojde dříve. Je-li teplota vyšší než 33 stupňů po delší dobu, dojde k úhynu embryí.Teplota v inkubátoru by se měla udržovat tak kolem 26-30C. Při vyšších teplotách se vylíhne většina samečků a při nižších většina samiček.

Používáme-li inkubátor s vodním ohřevem, měli bychom v době líhnutí přikrýt misku nějakou síťkou nebo něčím, co by zabránilo čerstvě vylíhnutým mláďatům spadnout do vody a utopit se. Terárium pro malé agamky by mělo být menší formou terária rodičovského páru.